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오영민	2003-01-12 23:21:07 \| Hit : 4429 \| Vote : 1134

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λ phage DNA molecule

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# Gene organization in the λ DNA molecule
* head-and-tail phage
* 49 kb in size
* λ genetic map의 특징은 genome에서 가능에 연관된 gene끼리 함께 cluster되어 있다는 것이다.
--> relating gene의 clustering은 individually 보다 group으로서 gene의 switch on/off에 의해 λ genome의 expression의 control에 중요하다.

# The linear and circular forms of λ DNA
* λ phage의 DNA molecule은 linear이다.
* phage head structure에서 나타나는 두개의 free end를 가진 DNA이다.
* linear molecule은 base-pairing을 이루는 double stranded DNA인 두개의 complementary strand로 구성
* molecule의 끝은 12개의 nucleotide stretch인 single strand이다. 두개의 single strand는 complementary하여 base pairing이 가능하여 circular form을 이뤄 완벽한 double strand molecule을 이룬다.
* sticky end (=cohesive end)
그들 사이의 base pairing이 DNA molecule의 두 끝이 함께 붙을 수 있어서 complementary single strand이라 칭한다.
* cos site (λ cohesive end)
- bacterial genome에 insertion 하기 위한 필수 prerequisite linear DNA molecule --> cell 안으로 들어가서 circularised 된다.
- prophage 후에 host genome에서 잘린 후, 많은 새로운 λ DNA molecule이 rolling circle mechanism of replication에 의해 생산된다. --> continuous DNA strand가 template molecule에서 rolled off 된다.
- cos site로 join 된 linear λ genome의 series로 구성된 catenane이 나온다.
- individual λ genome(gene A)에 의해 생산된 endonuclease에 의해 이 cos site가 recognition sequence로 작용한다.
- endonuclease는 single-stranded sticky end를 만들며, phage head structure에 각 λ genome을 package 하기 위해 다른 protein과 conjugation하여 작용

∴ λ genome의 internal region의 changing the structure는 λ genome의 전체 길이가 너무 많이 바뀌지 않으면 이상이 없다.

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